Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJB2P29033 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJB2P29033 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms