Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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