Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms