Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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