Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRHP20396 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms