Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HPGDP15428 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HPGDP15428 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HPGDP15428 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HPGDP15428 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HPGDP15428 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HPGDP15428 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HPGDP15428 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HPGDP15428 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HPGDP15428 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms