Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A1P13866 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms