Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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