Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR5O60602 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR5O60602 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR5O60602 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms