Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms