Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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