Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAJB4Q9UDY4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms