Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms