Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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