Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms