Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms