Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms