Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms