Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTK2BQ14289 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTK2BQ14289 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms