Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPIDRQ14159 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms