Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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