Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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