Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms