Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms