Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms