Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREMQ03060 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms