Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN2Q02246 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms