Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms