Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms