Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms