Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NESP48681 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NESP48681 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NESP48681 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NESP48681 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms