Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms