Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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