Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms