Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM21P19474 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms