Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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