Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms