Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms