Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C6orf47O95873 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C6orf47O95873 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms