Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJB6O95452 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJB6O95452 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJB6O95452 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms