Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG7O95352 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG7O95352 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.9 ms