Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms