Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K4Q9Y6R4 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms