Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms