Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms