Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNS3Q9BQ31 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms