Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
AKAP9Q99996 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms