Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms