Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SAMD8Q96LT4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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