Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms